Quando Papa Clemente VII ordinò di scavare il Pozzo della Cava, fu necessario demolire una parte di una abitazione privata per realizzare un grande arco che permettesse alla cittadinanza di attingere acqua direttamente da Via della Cava.
Nel 1646 le autorità comunali ordinarono la chiusura del pozzo, provvedendo a far murare completamente il grande arco realizzato nel secolo precedente, ed apponendovi una lapide in cui si ricordava ai cittadini la presenza di un «pozzo di acqua sorgiva» chiuso «per giusti motivi».



Come accennato nella pagina dedicata alla storia del Pozzo della Cava, una credenza popolare vuole che sia stato chiuso perché vi erano stati gettati cinque ufficiali francesi che avevano tentato di violentare le donne del quartiere.
Secondo altre ipotesi, invece, la chiusura del 1646 andrebbe fatta risalire al periodo della guerra di Castro, durante il quale l'intera Via della Cava fu trasformata in una fortificazione, murando tutte le aperture e i vicoli che vi si affacciavano.
I lavori del 2004 hanno ripristinato il grande arco rinascimentale, collocando, dove si trovava la vera originale, un piccolo puteale in pietra disegnato seguendo le linee del basamento della cisterna di Piazza del Popolo, ad Orvieto, fatta realizzare dallo stesso Papa Clemente VII.

La rimozione della lapide apposta al momento della chiusura ha poi permesso di scoprire che l'iscrizione era stata scolpita sul retro di una spessa lastra di marmo altomedievale con dei bellissimi bassorilievi in stile carolingio,
proveniente dai sotterranei della Collegiata dei Santi Andrea e Bartolomeo*, a circa duecento metri dal Pozzo della Cava.


* altre ipotesi sugeriscono addirittura una provenienza dalla antica cattedrale di Santa Maria Prisca, abbattuta per edificare l'attuale Duomo